預測小分子抗癌活性有了新算法
2012-12-20
本報訊（記者張雯雯）記者從中科院昆明動物研究所獲悉，該所李功華博士在研究員黃京飛的指導下，開發(fā)了一個新的基于分子藥效團的小分子比對算法，并成功應(yīng)用于預測小分子的抗癌活性。近日，該研究發(fā)表在頂級計算生物學雜志《生物信息學》上。
據(jù)李功華介紹，開發(fā)新的抗癌藥物是科學界和醫(yī)學界的熱點和難點。直接采用實驗的方法篩選抗癌藥物具有花費大、時間長的特點。以小分子為例，現(xiàn)在已知的小分子化合物超過了1000萬個，因此，直接采用實驗的方法從這1000萬個化合物中篩選藥物小分子幾乎是不可能的。因此，建立一個高效、可靠、準確的抗癌藥物的計算生物學篩選系統(tǒng)對發(fā)掘新的抗癌藥物具有重要意義。
為建立抗癌藥物活性的計算生物學預測系統(tǒng)，李功華開發(fā)了一個新的基于分子藥效團的小分子比對算法，通過交叉驗證發(fā)現(xiàn)其預測的線下面積達到了0.878，顯示該算法能很好地預測藥物小分子的抗癌活性。同時，李功華還開發(fā)了一個簡便易用的預測抗癌藥物活性的網(wǎng)頁服務(wù)器，使該算法能被不同學科的研究者和醫(yī)藥工作者所應(yīng)用。
